当山は昭和四年、新潟市江南区沢海の曹洞宗専門僧堂大栄寺二十九世耕雲珍龍大和尚が現在地に大栄寺出張所を構えました。これが大仙寺の始まりです。以前は吉塚イチという女流実業家のお屋敷でしたが、珍龍大和尚の信者となって、この土地を寄贈して自ら開基致しました。
昭和二十七年出張所から寺格法地大仙寺になり、昭和三十年現在墓地のあるところに、当山二世中興大徳龍仙大和尚が旧本堂を建立しました。平成二十六年には現住職大岳眞龍大和尚によって、現在の本堂を建立しました。
また境内には、豊川叱枳尼真天を祀り毎年五月十日に観音様と稲荷様の祭典が執行されています。